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想在貴公司合成miRNA或mRNA FISH探針,需要提供那些信息?
需要提供的信息:① 種屬(Human, Mouse, Rat, Rabbit等);② 基因名稱,未知的基因需要提供序列;
mRNA或miRNA探針的價格是多少,能檢測多少片子,標記探針的周期?都包括那些內容,是否包含陰性對照、FISH雜交液等輔助組分?
mRNA或miRNA探針價格2800元,體積是50μl,和雜交液按1:50-100稀釋,能檢測100-200張片子。 mRNA或miRNA探針的備貨周期,自客戶確認下訂單日起計,2周內發(fā)貨。 mRNA或miRNA包括了1ml FISH RNA 雜交液、1ml DAPI-抗熒光淬滅封片劑、50μl陰性對照或陽性對照探針(陰性、陽性對照只能選一種)。
貴公司合成的mRNA探針,是cDNA探針,還是cRNA探針,長度大概多少?
我們合成的mRNA探針屬于cRNA探針,長度40-600bp。
檢測的標準收費;檢測沒有結果,如何收費?
miRNA和mRNA的檢測費用相同: 每個標本1800元/標本,不包含目的探針的費用,但包含對照U6 (miRNA) 或GAPDH (mRNA)的內參探針費用和檢測費用,拍照及結果統(tǒng)計。 如果陽性對照有結果,無論miRNA或mRNA是否有結果,均正常收費,如果對照U6沒有結果,不收檢測費。
DNA FISH探針收費,如何保證質量?
每個目的基因探針3600元,15T,對照探針3600元,15T,贈送DAPI-抗熒光淬滅封片劑(封片的同時,減緩熒光淬滅),另本公司還提供專門針對DNA FISH的檢測試劑盒。 探針標記之后,我們都會進行中期染色體質檢,質量過關才發(fā)貨。
檢測miRNA或mRNA標本的收集、處理與保存
石蠟切片:石蠟塊或石蠟切片保存時間不超過5年的標本可以檢測miRNA,不超過半年的標本可以檢測mRNA。 收集標本后,請立即用10%中性福爾馬林浸泡,固定24小時后,石蠟包埋切片。收集到標本后,最好立即固定,然后切片,不要將標本儲存在-80℃,-80℃儲存后影響實驗結果。 冰凍切片:取標本后,立即-80℃冰凍,如果不能馬上切片,-80℃保存,干冰運輸。冰凍切片保存時間不超過2年的標本可以檢測miRNA 或mRNA。
如何用FISH定位某個基因?
例如:需要檢測兩個目的基因,例如MLAA-34及MLAA-22,能用FISH做這個兩個基因的染色體定位嗎?如果是檢測這兩個基因在哪幾號染色體的哪個區(qū)段,2個(探針)混合在一起檢測,能達到效果嗎? 對于已知基因,想定位某個基因在哪幾號染色體上,通過“目的基因探針和染色體對照探針”結合起來,才能實現(xiàn),單純地用使用某個目的基因探針,是不能定位的。 對于未知基因,由于不知道使用哪個染色體的對照探針,所以只能靠Gimsa染色后,再做FISH!癎imsa+FISH”檢測周期至少1個月。
想針對一個1000bp左右的片段設計DNA探針,單拷貝的,可行嗎?
片段比較小,直接熒光標記(FITC,Texas Red、Rhodamin)探針很難檢測出來。可以用地高辛標記的探針,熒光信息放大系統(tǒng)(ABC或TSA放大系統(tǒng) )嘗試一下,但是不保證能檢測到,文獻報道過檢測到的最短的片段是780bp。
探針的用量是否與涂片的濃度有關?比如,一張玻片上一千個細胞,另一張是一百個細胞,探針用量一樣嗎?
與細胞數(shù)量的關系不大,一般20mm×20mm玻片面積(蓋玻片),5-10μl探針已經(jīng)足夠。 探針的用量一般取決于標本面積的大小和所使用的蓋玻片的大小,使用20mm×20mm的蓋玻片,加5-10μl探針,使用20mm×40mm的蓋玻片,加10-20μl探針。
檢測某個融合基因,熒光定量或FISH方法,哪種好一點。
如果是已知的位點,可以做RT-PCR;如果是未知位點,則要用FISH檢測; RT-PCR檢測的費用較低,F(xiàn)ISH費用比較昂貴。
貴公司生物的DNA FISH探針對標本有什么要求,制備好中期染色體涂片的R顯帶可以嗎?到時可不可以一起雜交?
我們公司生產的探針適用于中期染色體滴片、細胞爬片、石蠟切片、可以R顯帶,但是R顯帶制備比較難,制備G顯帶的多一些(G顯帶每標本1000元)。但是R帶與FISH結合的概率很小,所以做起來有一定的難度。
檢測某基因的拷貝數(shù),是不是只能通過FISH檢測,RT-PCR能檢測嗎?
RT-PCR不能檢測某基因的拷貝數(shù)或者是否擴增,它檢測的是基因表達的相對高低。 檢測某個基因的拷貝數(shù),只能通過FISH檢測。
細胞本身帶GFP綠色熒光,使用地高辛標記miRNA的探針,抗地高辛的羅丹明熒光二抗,還有DAPI,細胞本身帶GFP綠色熒光會不會對熒光二抗和DAPI的顯色產生影響?
不會影響熒光二抗和DAPI的顯色(DAPI是藍色,GFP是綠色,羅丹明熒光二抗是紅色的),但是容易串色。
觀察DAPI的熒光應使用哪種濾光片,會不會和GFP重疊?
觀察DAPI應該使用紫外濾光片或者波長在300~400nm的都可以(激發(fā)波長和發(fā)射波長),一般熒光顯微鏡都有。 有可能串色,但是影響不大。我們實驗室曾做過,細胞自身帶GFP綠色熒光和紅色熒光的FISH。
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